Protein–RNA interactions for Protein: O95395

GCNT3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT3O95395 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCNT3O95395 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCNT3O95395 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCNT3O95395 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNT3O95395 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNT3O95395 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms