Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABARAPO95166 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABARAPO95166 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABARAPO95166 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABARAPO95166 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABARAPO95166 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms