Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP19O94966 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP19O94966 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP19O94966 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP19O94966 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP19O94966 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
USP19O94966 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
USP19O94966 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
USP19O94966 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
USP19O94966 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
USP19O94966 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP19O94966 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP19O94966 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
USP19O94966 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
USP19O94966 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
USP19O94966 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
USP19O94966 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
USP19O94966 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
USP19O94966 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
USP19O94966 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
USP19O94966 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
USP19O94966 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP19O94966 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP19O94966 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP19O94966 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
USP19O94966 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP19O94966 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
USP19O94966 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP19O94966 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP19O94966 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP19O94966 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP19O94966 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP19O94966 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP19O94966 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
USP19O94966 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
USP19O94966 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP19O94966 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP19O94966 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP19O94966 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
USP19O94966 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
USP19O94966 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP19O94966 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP19O94966 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
USP19O94966 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP19O94966 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP19O94966 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP19O94966 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP19O94966 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP19O94966 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP19O94966 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP19O94966 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP19O94966 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP19O94966 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP19O94966 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
USP19O94966 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP19O94966 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
USP19O94966 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
USP19O94966 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
USP19O94966 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
USP19O94966 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP19O94966 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
USP19O94966 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP19O94966 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
USP19O94966 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP19O94966 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP19O94966 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
USP19O94966 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP19O94966 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
USP19O94966 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP19O94966 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
USP19O94966 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP19O94966 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP19O94966 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP19O94966 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
USP19O94966 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP19O94966 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
USP19O94966 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
USP19O94966 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
USP19O94966 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
USP19O94966 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
USP19O94966 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP19O94966 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP19O94966 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP19O94966 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
USP19O94966 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP19O94966 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP19O94966 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP19O94966 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP19O94966 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
USP19O94966 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP19O94966 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP19O94966 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP19O94966 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP19O94966 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP19O94966 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
USP19O94966 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP19O94966 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP19O94966 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP19O94966 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
USP19O94966 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms