Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK1O94907 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK1O94907 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK1O94907 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK1O94907 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK1O94907 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK1O94907 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK1O94907 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DKK1O94907 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DKK1O94907 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DKK1O94907 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK1O94907 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK1O94907 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK1O94907 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK1O94907 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DKK1O94907 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK1O94907 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK1O94907 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DKK1O94907 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK1O94907 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK1O94907 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK1O94907 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK1O94907 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK1O94907 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK1O94907 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK1O94907 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK1O94907 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK1O94907 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DKK1O94907 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK1O94907 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK1O94907 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK1O94907 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK1O94907 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DKK1O94907 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK1O94907 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK1O94907 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DKK1O94907 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DKK1O94907 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DKK1O94907 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK1O94907 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK1O94907 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DKK1O94907 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK1O94907 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK1O94907 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK1O94907 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK1O94907 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DKK1O94907 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DKK1O94907 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DKK1O94907 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DKK1O94907 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DKK1O94907 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DKK1O94907 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK1O94907 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK1O94907 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK1O94907 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK1O94907 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK1O94907 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DKK1O94907 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK1O94907 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK1O94907 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DKK1O94907 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK1O94907 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK1O94907 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DKK1O94907 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKK1O94907 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DKK1O94907 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DKK1O94907 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DKK1O94907 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK1O94907 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK1O94907 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK1O94907 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK1O94907 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK1O94907 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DKK1O94907 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK1O94907 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK1O94907 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK1O94907 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK1O94907 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK1O94907 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK1O94907 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK1O94907 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DKK1O94907 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK1O94907 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK1O94907 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DKK1O94907 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK1O94907 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK1O94907 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK1O94907 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK1O94907 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DKK1O94907 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK1O94907 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK1O94907 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK1O94907 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK1O94907 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK1O94907 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK1O94907 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK1O94907 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DKK1O94907 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK1O94907 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DKK1O94907 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms