Protein–RNA interactions for Protein: O75674

TOM1L1, TOM1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L1O75674 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TOM1L1O75674 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TOM1L1O75674 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOM1L1O75674 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOM1L1O75674 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TOM1L1O75674 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOM1L1O75674 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOM1L1O75674 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TOM1L1O75674 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TOM1L1O75674 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TOM1L1O75674 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TOM1L1O75674 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L1O75674 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L1O75674 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TOM1L1O75674 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TOM1L1O75674 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L1O75674 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TOM1L1O75674 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L1O75674 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L1O75674 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L1O75674 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L1O75674 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TOM1L1O75674 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TOM1L1O75674 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TOM1L1O75674 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOM1L1O75674 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOM1L1O75674 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TOM1L1O75674 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOM1L1O75674 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOM1L1O75674 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOM1L1O75674 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOM1L1O75674 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TOM1L1O75674 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOM1L1O75674 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOM1L1O75674 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TOM1L1O75674 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TOM1L1O75674 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms