Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM3O75607 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NPM3O75607 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NPM3O75607 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NPM3O75607 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NPM3O75607 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NPM3O75607 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NPM3O75607 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NPM3O75607 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NPM3O75607 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NPM3O75607 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NPM3O75607 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NPM3O75607 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NPM3O75607 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NPM3O75607 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NPM3O75607 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NPM3O75607 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM3O75607 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM3O75607 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM3O75607 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM3O75607 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NPM3O75607 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NPM3O75607 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NPM3O75607 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NPM3O75607 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NPM3O75607 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NPM3O75607 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NPM3O75607 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NPM3O75607 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NPM3O75607 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM3O75607 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM3O75607 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM3O75607 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM3O75607 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NPM3O75607 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPM3O75607 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPM3O75607 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPM3O75607 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPM3O75607 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NPM3O75607 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPM3O75607 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPM3O75607 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NPM3O75607 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM3O75607 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM3O75607 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM3O75607 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NPM3O75607 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPM3O75607 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPM3O75607 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPM3O75607 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPM3O75607 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPM3O75607 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NPM3O75607 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NPM3O75607 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NPM3O75607 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NPM3O75607 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPM3O75607 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NPM3O75607 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM3O75607 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM3O75607 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM3O75607 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM3O75607 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM3O75607 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM3O75607 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NPM3O75607 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NPM3O75607 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPM3O75607 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPM3O75607 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NPM3O75607 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NPM3O75607 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NPM3O75607 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPM3O75607 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPM3O75607 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM3O75607 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM3O75607 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM3O75607 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM3O75607 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM3O75607 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM3O75607 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM3O75607 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM3O75607 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM3O75607 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM3O75607 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM3O75607 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM3O75607 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM3O75607 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM3O75607 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPM3O75607 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPM3O75607 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPM3O75607 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPM3O75607 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPM3O75607 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPM3O75607 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPM3O75607 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPM3O75607 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPM3O75607 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPM3O75607 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPM3O75607 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPM3O75607 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NPM3O75607 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms