Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GCM2O75603 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCM2O75603 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCM2O75603 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCM2O75603 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCM2O75603 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCM2O75603 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCM2O75603 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCM2O75603 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCM2O75603 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCM2O75603 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCM2O75603 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCM2O75603 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCM2O75603 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GCM2O75603 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCM2O75603 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCM2O75603 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCM2O75603 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCM2O75603 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCM2O75603 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCM2O75603 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCM2O75603 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCM2O75603 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCM2O75603 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCM2O75603 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCM2O75603 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCM2O75603 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCM2O75603 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCM2O75603 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCM2O75603 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCM2O75603 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCM2O75603 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCM2O75603 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCM2O75603 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCM2O75603 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCM2O75603 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCM2O75603 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCM2O75603 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCM2O75603 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCM2O75603 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCM2O75603 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCM2O75603 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCM2O75603 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCM2O75603 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCM2O75603 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCM2O75603 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCM2O75603 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCM2O75603 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCM2O75603 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCM2O75603 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCM2O75603 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCM2O75603 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCM2O75603 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCM2O75603 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCM2O75603 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCM2O75603 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCM2O75603 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCM2O75603 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCM2O75603 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCM2O75603 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCM2O75603 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCM2O75603 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCM2O75603 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GCM2O75603 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCM2O75603 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCM2O75603 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCM2O75603 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCM2O75603 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCM2O75603 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCM2O75603 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCM2O75603 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCM2O75603 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GCM2O75603 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCM2O75603 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCM2O75603 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCM2O75603 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCM2O75603 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCM2O75603 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCM2O75603 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCM2O75603 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCM2O75603 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCM2O75603 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCM2O75603 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCM2O75603 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCM2O75603 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GCM2O75603 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCM2O75603 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCM2O75603 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GCM2O75603 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCM2O75603 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCM2O75603 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCM2O75603 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCM2O75603 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCM2O75603 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GCM2O75603 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCM2O75603 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCM2O75603 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCM2O75603 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCM2O75603 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GCM2O75603 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms