Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX11O75558 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX11O75558 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX11O75558 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX11O75558 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX11O75558 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX11O75558 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX11O75558 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX11O75558 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX11O75558 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX11O75558 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX11O75558 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
STX11O75558 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
STX11O75558 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX11O75558 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX11O75558 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX11O75558 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
STX11O75558 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX11O75558 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX11O75558 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX11O75558 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX11O75558 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX11O75558 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
STX11O75558 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX11O75558 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
STX11O75558 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX11O75558 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX11O75558 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX11O75558 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX11O75558 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX11O75558 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
STX11O75558 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
STX11O75558 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX11O75558 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX11O75558 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX11O75558 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX11O75558 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX11O75558 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX11O75558 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX11O75558 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX11O75558 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
STX11O75558 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX11O75558 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX11O75558 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX11O75558 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
STX11O75558 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX11O75558 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX11O75558 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX11O75558 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX11O75558 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
STX11O75558 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX11O75558 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
STX11O75558 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX11O75558 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX11O75558 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX11O75558 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX11O75558 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX11O75558 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX11O75558 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
STX11O75558 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX11O75558 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX11O75558 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX11O75558 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX11O75558 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX11O75558 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX11O75558 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX11O75558 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STX11O75558 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX11O75558 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX11O75558 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX11O75558 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX11O75558 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX11O75558 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX11O75558 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX11O75558 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX11O75558 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX11O75558 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX11O75558 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX11O75558 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX11O75558 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX11O75558 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX11O75558 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX11O75558 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX11O75558 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STX11O75558 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX11O75558 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX11O75558 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX11O75558 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX11O75558 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX11O75558 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX11O75558 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STX11O75558 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STX11O75558 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STX11O75558 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STX11O75558 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STX11O75558 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STX11O75558 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STX11O75558 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STX11O75558 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STX11O75558 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms