Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F6O75461 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F6O75461 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
E2F6O75461 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F6O75461 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F6O75461 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F6O75461 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F6O75461 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F6O75461 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F6O75461 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
E2F6O75461 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F6O75461 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F6O75461 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F6O75461 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F6O75461 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
E2F6O75461 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F6O75461 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F6O75461 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F6O75461 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F6O75461 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F6O75461 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F6O75461 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
E2F6O75461 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
E2F6O75461 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F6O75461 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
E2F6O75461 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F6O75461 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F6O75461 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F6O75461 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F6O75461 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
E2F6O75461 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F6O75461 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F6O75461 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F6O75461 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
E2F6O75461 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F6O75461 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F6O75461 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F6O75461 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
E2F6O75461 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F6O75461 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F6O75461 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
E2F6O75461 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F6O75461 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F6O75461 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F6O75461 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F6O75461 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F6O75461 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F6O75461 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F6O75461 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F6O75461 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
E2F6O75461 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
E2F6O75461 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F6O75461 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F6O75461 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
E2F6O75461 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F6O75461 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F6O75461 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
E2F6O75461 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F6O75461 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F6O75461 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
E2F6O75461 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F6O75461 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
E2F6O75461 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F6O75461 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F6O75461 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F6O75461 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F6O75461 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
E2F6O75461 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F6O75461 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F6O75461 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F6O75461 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
E2F6O75461 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F6O75461 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
E2F6O75461 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
E2F6O75461 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F6O75461 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F6O75461 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F6O75461 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F6O75461 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F6O75461 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F6O75461 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
E2F6O75461 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F6O75461 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F6O75461 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
E2F6O75461 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F6O75461 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F6O75461 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F6O75461 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F6O75461 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
E2F6O75461 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F6O75461 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F6O75461 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F6O75461 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F6O75461 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F6O75461 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
E2F6O75461 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F6O75461 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F6O75461 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F6O75461 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
E2F6O75461 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms