Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS26AO75436 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VPS26AO75436 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS26AO75436 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS26AO75436 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms