Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NIPSNAP2O75323 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NIPSNAP2O75323 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NIPSNAP2O75323 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NIPSNAP2O75323 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms