Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSVO60911 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSVO60911 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSVO60911 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSVO60911 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSVO60911 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSVO60911 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSVO60911 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSVO60911 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSVO60911 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSVO60911 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSVO60911 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSVO60911 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSVO60911 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSVO60911 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSVO60911 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSVO60911 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSVO60911 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSVO60911 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSVO60911 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSVO60911 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSVO60911 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSVO60911 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSVO60911 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSVO60911 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSVO60911 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSVO60911 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSVO60911 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSVO60911 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSVO60911 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSVO60911 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSVO60911 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSVO60911 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSVO60911 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSVO60911 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSVO60911 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSVO60911 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSVO60911 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSVO60911 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSVO60911 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSVO60911 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSVO60911 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSVO60911 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSVO60911 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSVO60911 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSVO60911 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSVO60911 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSVO60911 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSVO60911 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSVO60911 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSVO60911 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSVO60911 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSVO60911 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSVO60911 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSVO60911 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSVO60911 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSVO60911 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSVO60911 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSVO60911 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSVO60911 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSVO60911 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSVO60911 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSVO60911 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSVO60911 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSVO60911 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSVO60911 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSVO60911 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSVO60911 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSVO60911 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSVO60911 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSVO60911 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSVO60911 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSVO60911 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSVO60911 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSVO60911 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSVO60911 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSVO60911 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSVO60911 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSVO60911 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSVO60911 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSVO60911 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSVO60911 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSVO60911 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSVO60911 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSVO60911 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSVO60911 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSVO60911 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSVO60911 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSVO60911 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSVO60911 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSVO60911 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSVO60911 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSVO60911 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSVO60911 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSVO60911 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSVO60911 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSVO60911 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSVO60911 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSVO60911 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSVO60911 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms