Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFDO43915 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VEGFDO43915 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VEGFDO43915 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
VEGFDO43915 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VEGFDO43915 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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