Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3O43889 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3O43889 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3O43889 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3O43889 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CREB3O43889 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3O43889 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3O43889 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3O43889 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CREB3O43889 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3O43889 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3O43889 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3O43889 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3O43889 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CREB3O43889 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CREB3O43889 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CREB3O43889 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CREB3O43889 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3O43889 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3O43889 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3O43889 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3O43889 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3O43889 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3O43889 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CREB3O43889 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3O43889 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3O43889 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3O43889 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3O43889 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CREB3O43889 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CREB3O43889 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CREB3O43889 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3O43889 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CREB3O43889 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3O43889 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3O43889 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CREB3O43889 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3O43889 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3O43889 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3O43889 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3O43889 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3O43889 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3O43889 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3O43889 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3O43889 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3O43889 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CREB3O43889 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3O43889 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3O43889 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CREB3O43889 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CREB3O43889 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3O43889 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3O43889 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CREB3O43889 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CREB3O43889 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3O43889 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3O43889 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3O43889 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CREB3O43889 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3O43889 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CREB3O43889 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREB3O43889 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CREB3O43889 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3O43889 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3O43889 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CREB3O43889 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3O43889 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3O43889 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3O43889 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3O43889 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CREB3O43889 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3O43889 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3O43889 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CREB3O43889 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3O43889 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3O43889 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3O43889 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CREB3O43889 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3O43889 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3O43889 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3O43889 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3O43889 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3O43889 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3O43889 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CREB3O43889 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3O43889 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3O43889 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CREB3O43889 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3O43889 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3O43889 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3O43889 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3O43889 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3O43889 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CREB3O43889 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB3O43889 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB3O43889 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB3O43889 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CREB3O43889 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3O43889 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CREB3O43889 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms