Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUX1O43812 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUX1O43812 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUX1O43812 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUX1O43812 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUX1O43812 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUX1O43812 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUX1O43812 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUX1O43812 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUX1O43812 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUX1O43812 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUX1O43812 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUX1O43812 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUX1O43812 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUX1O43812 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DUX1O43812 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUX1O43812 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUX1O43812 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUX1O43812 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUX1O43812 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUX1O43812 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUX1O43812 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUX1O43812 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUX1O43812 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUX1O43812 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUX1O43812 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUX1O43812 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUX1O43812 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUX1O43812 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUX1O43812 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DUX1O43812 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUX1O43812 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUX1O43812 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DUX1O43812 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUX1O43812 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUX1O43812 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUX1O43812 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUX1O43812 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUX1O43812 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUX1O43812 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUX1O43812 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUX1O43812 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUX1O43812 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUX1O43812 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUX1O43812 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUX1O43812 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUX1O43812 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUX1O43812 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUX1O43812 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUX1O43812 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DUX1O43812 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DUX1O43812 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DUX1O43812 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
DUX1O43812 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUX1O43812 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DUX1O43812 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUX1O43812 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUX1O43812 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUX1O43812 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUX1O43812 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUX1O43812 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUX1O43812 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUX1O43812 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUX1O43812 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DUX1O43812 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUX1O43812 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUX1O43812 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUX1O43812 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUX1O43812 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUX1O43812 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUX1O43812 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DUX1O43812 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DUX1O43812 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUX1O43812 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUX1O43812 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUX1O43812 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUX1O43812 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUX1O43812 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUX1O43812 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUX1O43812 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUX1O43812 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUX1O43812 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DUX1O43812 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUX1O43812 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUX1O43812 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUX1O43812 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUX1O43812 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUX1O43812 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUX1O43812 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUX1O43812 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUX1O43812 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUX1O43812 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUX1O43812 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUX1O43812 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUX1O43812 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUX1O43812 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUX1O43812 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUX1O43812 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUX1O43812 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUX1O43812 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms