Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACTN4O43707 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACTN4O43707 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACTN4O43707 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACTN4O43707 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACTN4O43707 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms