Protein–RNA interactions for Protein: O43513

MED7, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED7O43513 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MED7O43513 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MED7O43513 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MED7O43513 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MED7O43513 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MED7O43513 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MED7O43513 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MED7O43513 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MED7O43513 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MED7O43513 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MED7O43513 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MED7O43513 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MED7O43513 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MED7O43513 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MED7O43513 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MED7O43513 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MED7O43513 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MED7O43513 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MED7O43513 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MED7O43513 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MED7O43513 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MED7O43513 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MED7O43513 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MED7O43513 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MED7O43513 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MED7O43513 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MED7O43513 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MED7O43513 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MED7O43513 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MED7O43513 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MED7O43513 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MED7O43513 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MED7O43513 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MED7O43513 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MED7O43513 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MED7O43513 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MED7O43513 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MED7O43513 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MED7O43513 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MED7O43513 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MED7O43513 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MED7O43513 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MED7O43513 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MED7O43513 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MED7O43513 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MED7O43513 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MED7O43513 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MED7O43513 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MED7O43513 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MED7O43513 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MED7O43513 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MED7O43513 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MED7O43513 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MED7O43513 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MED7O43513 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MED7O43513 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MED7O43513 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED7O43513 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED7O43513 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED7O43513 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED7O43513 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MED7O43513 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MED7O43513 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MED7O43513 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED7O43513 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED7O43513 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED7O43513 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED7O43513 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED7O43513 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED7O43513 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED7O43513 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED7O43513 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED7O43513 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED7O43513 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED7O43513 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED7O43513 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED7O43513 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED7O43513 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED7O43513 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MED7O43513 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED7O43513 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MED7O43513 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED7O43513 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED7O43513 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED7O43513 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED7O43513 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED7O43513 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED7O43513 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED7O43513 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MED7O43513 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED7O43513 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED7O43513 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED7O43513 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED7O43513 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MED7O43513 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MED7O43513 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MED7O43513 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MED7O43513 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MED7O43513 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MED7O43513 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms