Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERI3O43414 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERI3O43414 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERI3O43414 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERI3O43414 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERI3O43414 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERI3O43414 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERI3O43414 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERI3O43414 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERI3O43414 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERI3O43414 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERI3O43414 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERI3O43414 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERI3O43414 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERI3O43414 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERI3O43414 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERI3O43414 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERI3O43414 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERI3O43414 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERI3O43414 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERI3O43414 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERI3O43414 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERI3O43414 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERI3O43414 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERI3O43414 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ERI3O43414 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERI3O43414 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERI3O43414 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERI3O43414 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERI3O43414 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERI3O43414 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERI3O43414 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERI3O43414 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERI3O43414 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERI3O43414 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERI3O43414 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERI3O43414 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERI3O43414 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERI3O43414 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERI3O43414 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERI3O43414 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERI3O43414 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERI3O43414 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERI3O43414 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERI3O43414 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERI3O43414 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERI3O43414 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERI3O43414 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERI3O43414 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERI3O43414 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERI3O43414 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERI3O43414 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERI3O43414 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERI3O43414 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERI3O43414 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERI3O43414 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERI3O43414 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERI3O43414 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERI3O43414 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERI3O43414 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERI3O43414 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERI3O43414 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERI3O43414 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERI3O43414 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERI3O43414 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERI3O43414 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERI3O43414 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ERI3O43414 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERI3O43414 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERI3O43414 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERI3O43414 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERI3O43414 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERI3O43414 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERI3O43414 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERI3O43414 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERI3O43414 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERI3O43414 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERI3O43414 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERI3O43414 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ERI3O43414 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERI3O43414 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERI3O43414 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERI3O43414 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ERI3O43414 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ERI3O43414 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERI3O43414 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERI3O43414 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERI3O43414 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ERI3O43414 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERI3O43414 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ERI3O43414 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERI3O43414 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ERI3O43414 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERI3O43414 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ERI3O43414 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ERI3O43414 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ERI3O43414 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERI3O43414 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ERI3O43414 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERI3O43414 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms