Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF3O43395 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF3O43395 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF3O43395 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF3O43395 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF3O43395 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF3O43395 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRPF3O43395 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PRPF3O43395 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF3O43395 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRPF3O43395 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRPF3O43395 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF3O43395 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF3O43395 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms