Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSI1O43347 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSI1O43347 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSI1O43347 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSI1O43347 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSI1O43347 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MSI1O43347 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSI1O43347 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSI1O43347 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MSI1O43347 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSI1O43347 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSI1O43347 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSI1O43347 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSI1O43347 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSI1O43347 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MSI1O43347 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MSI1O43347 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MSI1O43347 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MSI1O43347 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSI1O43347 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSI1O43347 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MSI1O43347 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSI1O43347 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSI1O43347 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSI1O43347 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSI1O43347 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MSI1O43347 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSI1O43347 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSI1O43347 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSI1O43347 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSI1O43347 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSI1O43347 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSI1O43347 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSI1O43347 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSI1O43347 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSI1O43347 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSI1O43347 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSI1O43347 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSI1O43347 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSI1O43347 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSI1O43347 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSI1O43347 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSI1O43347 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MSI1O43347 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MSI1O43347 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSI1O43347 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSI1O43347 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSI1O43347 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSI1O43347 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSI1O43347 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSI1O43347 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSI1O43347 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSI1O43347 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSI1O43347 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSI1O43347 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSI1O43347 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSI1O43347 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSI1O43347 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSI1O43347 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSI1O43347 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MSI1O43347 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSI1O43347 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSI1O43347 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MSI1O43347 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSI1O43347 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSI1O43347 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSI1O43347 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSI1O43347 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSI1O43347 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSI1O43347 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSI1O43347 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSI1O43347 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSI1O43347 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSI1O43347 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
MSI1O43347 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSI1O43347 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSI1O43347 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSI1O43347 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSI1O43347 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSI1O43347 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSI1O43347 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSI1O43347 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSI1O43347 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSI1O43347 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSI1O43347 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MSI1O43347 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSI1O43347 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MSI1O43347 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSI1O43347 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MSI1O43347 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSI1O43347 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSI1O43347 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSI1O43347 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSI1O43347 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MSI1O43347 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSI1O43347 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSI1O43347 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSI1O43347 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSI1O43347 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MSI1O43347 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms