Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MTSS1O43312 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTSS1O43312 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTSS1O43312 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MTSS1O43312 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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