Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD3O43242 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD3O43242 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD3O43242 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD3O43242 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms