Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD51BO15315 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD51BO15315 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD51BO15315 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD51BO15315 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD51BO15315 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD51BO15315 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD51BO15315 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD51BO15315 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD51BO15315 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms