Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PFDN6O15212 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PFDN6O15212 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PFDN6O15212 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PFDN6O15212 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms