Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHUKO15111 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHUKO15111 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHUKO15111 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHUKO15111 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHUKO15111 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHUKO15111 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHUKO15111 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHUKO15111 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHUKO15111 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHUKO15111 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHUKO15111 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHUKO15111 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHUKO15111 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHUKO15111 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHUKO15111 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHUKO15111 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHUKO15111 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHUKO15111 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHUKO15111 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHUKO15111 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHUKO15111 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHUKO15111 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHUKO15111 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHUKO15111 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHUKO15111 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHUKO15111 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHUKO15111 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHUKO15111 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHUKO15111 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHUKO15111 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHUKO15111 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHUKO15111 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHUKO15111 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHUKO15111 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHUKO15111 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHUKO15111 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHUKO15111 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHUKO15111 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHUKO15111 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHUKO15111 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHUKO15111 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHUKO15111 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHUKO15111 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHUKO15111 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHUKO15111 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHUKO15111 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHUKO15111 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHUKO15111 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHUKO15111 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHUKO15111 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHUKO15111 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHUKO15111 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHUKO15111 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHUKO15111 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHUKO15111 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHUKO15111 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHUKO15111 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHUKO15111 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHUKO15111 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHUKO15111 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHUKO15111 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHUKO15111 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHUKO15111 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHUKO15111 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHUKO15111 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHUKO15111 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHUKO15111 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHUKO15111 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHUKO15111 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHUKO15111 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHUKO15111 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHUKO15111 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHUKO15111 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHUKO15111 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHUKO15111 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHUKO15111 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHUKO15111 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHUKO15111 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHUKO15111 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHUKO15111 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHUKO15111 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHUKO15111 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHUKO15111 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHUKO15111 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHUKO15111 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHUKO15111 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHUKO15111 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHUKO15111 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHUKO15111 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHUKO15111 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHUKO15111 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHUKO15111 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHUKO15111 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHUKO15111 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHUKO15111 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHUKO15111 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHUKO15111 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHUKO15111 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHUKO15111 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms