Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
U2SURPO15042 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
U2SURPO15042 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
U2SURPO15042 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
U2SURPO15042 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
U2SURPO15042 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms