Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2A1O14983 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP2A1O14983 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP2A1O14983 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATP2A1O14983 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms