Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRF6O14896 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRF6O14896 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRF6O14896 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRF6O14896 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRF6O14896 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRF6O14896 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRF6O14896 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRF6O14896 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRF6O14896 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRF6O14896 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRF6O14896 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRF6O14896 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRF6O14896 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
IRF6O14896 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRF6O14896 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
IRF6O14896 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRF6O14896 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRF6O14896 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRF6O14896 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
IRF6O14896 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRF6O14896 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRF6O14896 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRF6O14896 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRF6O14896 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRF6O14896 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRF6O14896 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
IRF6O14896 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRF6O14896 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRF6O14896 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRF6O14896 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRF6O14896 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRF6O14896 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRF6O14896 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRF6O14896 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRF6O14896 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRF6O14896 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRF6O14896 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRF6O14896 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRF6O14896 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRF6O14896 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRF6O14896 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRF6O14896 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRF6O14896 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRF6O14896 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRF6O14896 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRF6O14896 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRF6O14896 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRF6O14896 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IRF6O14896 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
IRF6O14896 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRF6O14896 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRF6O14896 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRF6O14896 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRF6O14896 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRF6O14896 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRF6O14896 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRF6O14896 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRF6O14896 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRF6O14896 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRF6O14896 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRF6O14896 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRF6O14896 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRF6O14896 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRF6O14896 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRF6O14896 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRF6O14896 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRF6O14896 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRF6O14896 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRF6O14896 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRF6O14896 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRF6O14896 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
IRF6O14896 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
IRF6O14896 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
IRF6O14896 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRF6O14896 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRF6O14896 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRF6O14896 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRF6O14896 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRF6O14896 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRF6O14896 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRF6O14896 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRF6O14896 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRF6O14896 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
IRF6O14896 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
IRF6O14896 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRF6O14896 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRF6O14896 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRF6O14896 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
IRF6O14896 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRF6O14896 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRF6O14896 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
IRF6O14896 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
IRF6O14896 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
IRF6O14896 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRF6O14896 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRF6O14896 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRF6O14896 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRF6O14896 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IRF6O14896 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms