Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms