Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHLHE40O14503 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BHLHE40O14503 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BHLHE40O14503 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BHLHE40O14503 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BHLHE40O14503 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms