Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFRD1O00458 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFRD1O00458 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFRD1O00458 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFRD1O00458 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms