Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
H3BQV1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
H3BQV1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
H3BQV1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
H3BQV1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
H3BQV1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
H3BQV1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
H3BQV1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
H3BQV1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
H3BQV1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
H3BQV1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
H3BQV1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
H3BQV1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
H3BQV1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
H3BQV1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
H3BQV1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
H3BQV1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
H3BQV1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
H3BQV1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
H3BQV1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
H3BQV1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
H3BQV1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
H3BQV1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
H3BQV1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
H3BQV1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
H3BQV1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
H3BQV1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H3BQV1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H3BQV1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
H3BQV1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
H3BQV1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
H3BQV1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
H3BQV1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H3BQV1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H3BQV1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
H3BQV1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
H3BQV1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
H3BQV1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
H3BQV1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
H3BQV1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
H3BQV1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
H3BQV1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
H3BQV1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
H3BQV1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
H3BQV1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
H3BQV1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
H3BQV1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
H3BQV1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BQV1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BQV1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BQV1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BQV1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BQV1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BQV1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BQV1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BQV1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BQV1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BQV1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
H3BQV1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
H3BQV1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
H3BQV1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
H3BQV1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
H3BQV1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
H3BQV1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
H3BQV1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
H3BQV1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
H3BQV1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
H3BQV1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
H3BQV1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
H3BQV1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
H3BQV1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
H3BQV1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
H3BQV1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
H3BQV1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
H3BQV1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
H3BQV1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
H3BQV1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
H3BQV1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
H3BQV1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
H3BQV1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
H3BQV1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
H3BQV1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
H3BQV1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
H3BQV1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
H3BQV1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
H3BQV1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
H3BQV1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
H3BQV1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
H3BQV1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
H3BQV1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
H3BQV1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
H3BQV1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
H3BQV1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
H3BQV1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
H3BQV1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
H3BQV1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
H3BQV1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
H3BQV1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
H3BQV1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
H3BQV1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms