Protein–RNA interactions for Protein: D6RBQ6

USP17L17, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L17D6RBQ6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L17D6RBQ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L17D6RBQ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L17D6RBQ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
USP17L17D6RBQ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L17D6RBQ6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L17D6RBQ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L17D6RBQ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L17D6RBQ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L17D6RBQ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L17D6RBQ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L17D6RBQ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L17D6RBQ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L17D6RBQ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L17D6RBQ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L17D6RBQ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L17D6RBQ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms