Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
USP17L11C9JVI0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP17L11C9JVI0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP17L11C9JVI0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
USP17L11C9JVI0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L11C9JVI0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L11C9JVI0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L11C9JVI0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L11C9JVI0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L11C9JVI0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP17L11C9JVI0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L11C9JVI0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L11C9JVI0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP17L11C9JVI0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L11C9JVI0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L11C9JVI0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP17L11C9JVI0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms