Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
B4E171 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B4E171 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
B4E171 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
B4E171 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B4E171 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
B4E171 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
B4E171 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4E171 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
B4E171 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4E171 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B4E171 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
B4E171 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4E171 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4E171 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4E171 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
B4E171 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
B4E171 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
B4E171 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
B4E171 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
B4E171 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
B4E171 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
B4E171 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
B4E171 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
B4E171 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
B4E171 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
B4E171 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
B4E171 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
B4E171 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
B4E171 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
B4E171 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
B4E171 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
B4E171 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
B4E171 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
B4E171 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
B4E171 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
B4E171 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
B4E171 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
B4E171 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
B4E171 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
B4E171 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
B4E171 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
B4E171 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
B4E171 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
B4E171 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
B4E171 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
B4E171 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
B4E171 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
B4E171 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
B4E171 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
B4E171 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
B4E171 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
B4E171 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
B4E171 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
B4E171 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
B4E171 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
B4E171 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
B4E171 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
B4E171 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
B4E171 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
B4E171 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
B4E171 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
B4E171 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
B4E171 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
B4E171 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
B4E171 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
B4E171 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
B4E171 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B4E171 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
B4E171 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
B4E171 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
B4E171 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
B4E171 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
B4E171 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
B4E171 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
B4E171 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
B4E171 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
B4E171 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B4E171 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B4E171 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B4E171 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
B4E171 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
B4E171 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
B4E171 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
B4E171 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
B4E171 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
B4E171 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
B4E171 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
B4E171 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B4E171 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B4E171 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4E171 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4E171 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4E171 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4E171 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4E171 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4E171 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
B4E171 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4E171 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
B4E171 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms