Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
B4DEV8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
B4DEV8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
B4DEV8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
B4DEV8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
B4DEV8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
B4DEV8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
B4DEV8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
B4DEV8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
B4DEV8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
B4DEV8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
B4DEV8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
B4DEV8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
B4DEV8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
B4DEV8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
B4DEV8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
B4DEV8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
B4DEV8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
B4DEV8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
B4DEV8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DEV8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DEV8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DEV8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DEV8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DEV8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DEV8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DEV8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DEV8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
B4DEV8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DEV8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DEV8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DEV8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DEV8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
B4DEV8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DEV8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DEV8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DEV8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
B4DEV8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DEV8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DEV8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DEV8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DEV8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
B4DEV8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
B4DEV8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
B4DEV8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DEV8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DEV8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DEV8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DEV8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DEV8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DEV8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DEV8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DEV8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DEV8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DEV8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DEV8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DEV8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DEV8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DEV8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DEV8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DEV8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DEV8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DEV8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DEV8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DEV8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DEV8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DEV8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DEV8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DEV8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DEV8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DEV8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DEV8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DEV8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DEV8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DEV8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DEV8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DEV8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DEV8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DEV8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DEV8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DEV8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DEV8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DEV8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
B4DEV8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
B4DEV8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
B4DEV8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
B4DEV8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
B4DEV8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
B4DEV8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
B4DEV8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
B4DEV8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
B4DEV8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
B4DEV8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
B4DEV8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
B4DEV8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
B4DEV8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
B4DEV8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
B4DEV8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
B4DEV8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
B4DEV8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms