Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BECN2A8MW95 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BECN2A8MW95 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BECN2A8MW95 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BECN2A8MW95 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BECN2A8MW95 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms