Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMIM23A6NLE4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMIM23A6NLE4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMIM23A6NLE4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMIM23A6NLE4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms