Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH2D7A6NKC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH2D7A6NKC9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SH2D7A6NKC9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH2D7A6NKC9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SH2D7A6NKC9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH2D7A6NKC9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms