Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP73A6NFT4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CFAP73A6NFT4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP73A6NFT4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CFAP73A6NFT4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CFAP73A6NFT4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms