Protein–RNA interactions for Protein: A6NCK2

TRIM43B, Tripartite motif-containing protein 43B, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43BA6NCK2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM43BA6NCK2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM43BA6NCK2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM43BA6NCK2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM43BA6NCK2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM43BA6NCK2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM43BA6NCK2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms