Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC13A5PLN9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC13A5PLN9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC13A5PLN9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC13A5PLN9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms