Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A0A0J9YVX5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A0A0J9YVX5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0J9YVX5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A0J9YVX5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms