Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH59

TRBV5-4, T-cell receptor beta variable 5-4 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-4A0A0C4DH59 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBV5-4A0A0C4DH59 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBV5-4A0A0C4DH59 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRBV5-4A0A0C4DH59 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV5-4A0A0C4DH59 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV5-4A0A0C4DH59 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV5-4A0A0C4DH59 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRBV5-4A0A0C4DH59 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV5-4A0A0C4DH59 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TRBV5-4A0A0C4DH59 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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TRBV5-4A0A0C4DH59 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV5-4A0A0C4DH59 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBV5-4A0A0C4DH59 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
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