Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAV27A0A087WT01 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAV27A0A087WT01 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAV27A0A087WT01 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAV27A0A087WT01 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAV27A0A087WT01 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAV27A0A087WT01 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV27A0A087WT01 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV27A0A087WT01 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV27A0A087WT01 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV27A0A087WT01 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV27A0A087WT01 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV27A0A087WT01 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAV27A0A087WT01 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAV27A0A087WT01 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAV27A0A087WT01 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms