RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616306.1

UBXN8-208, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN8, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-208ENST00000616306 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
UBXN8-208ENST00000616306 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.02■■■□□ 2.4
UBXN8-208ENST00000616306 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
UBXN8-208ENST00000616306 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
UBXN8-208ENST00000616306 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.96■■□□□ 1.59
UBXN8-208ENST00000616306 FOXD1Q16676 465 aa24.7■■□□□ 1.54
UBXN8-208ENST00000616306 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.21■■□□□ 1.47
UBXN8-208ENST00000616306 ADRA2BP18089 450 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN8-208ENST00000616306 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.42■■□□□ 1.34
UBXN8-208ENST00000616306 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
UBXN8-208ENST00000616306 MSH5O43196 834 aa22.96■■□□□ 1.27
UBXN8-208ENST00000616306 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.32■■□□□ 1.16
UBXN8-208ENST00000616306 ABCC9O60706 1549 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN8-208ENST00000616306 POTEDQ86YR6 584 aa21.7■■□□□ 1.06
UBXN8-208ENST00000616306 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
UBXN8-208ENST00000616306 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UBXN8-208ENST00000616306 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.29■■□□□ 1
UBXN8-208ENST00000616306 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN8-208ENST00000616306 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.1■□□□□ 0.97
UBXN8-208ENST00000616306 NACADO15069 1562 aa21.02■□□□□ 0.96
UBXN8-208ENST00000616306 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.87■□□□□ 0.93
UBXN8-208ENST00000616306 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.86■□□□□ 0.93
UBXN8-208ENST00000616306 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.78■□□□□ 0.92
UBXN8-208ENST00000616306 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
UBXN8-208ENST00000616306 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.68■□□□□ 0.9
UBXN8-208ENST00000616306 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.62■□□□□ 0.89
UBXN8-208ENST00000616306 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
UBXN8-208ENST00000616306 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
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UBXN8-208ENST00000616306 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.45■□□□□ 0.86
UBXN8-208ENST00000616306 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.41■□□□□ 0.86
UBXN8-208ENST00000616306 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.34■□□□□ 0.85
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UBXN8-208ENST00000616306 KCNA4P22459 653 aa20.3■□□□□ 0.84
UBXN8-208ENST00000616306 SCRIBQ14160 1630 aa20.27■□□□□ 0.84
UBXN8-208ENST00000616306 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.26■□□□□ 0.83
UBXN8-208ENST00000616306 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
UBXN8-208ENST00000616306 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.89■□□□□ 0.77
UBXN8-208ENST00000616306 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.78■□□□□ 0.76
UBXN8-208ENST00000616306 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.64■□□□□ 0.73
UBXN8-208ENST00000616306 RNF39Q9H2S5 420 aa19.61■□□□□ 0.73
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UBXN8-208ENST00000616306 SMARCA4P51532 1647 aa19.41■□□□□ 0.7
UBXN8-208ENST00000616306 NCAPD3P42695 1498 aa19.4■□□□□ 0.7
UBXN8-208ENST00000616306 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
UBXN8-208ENST00000616306 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.35■□□□□ 0.69
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UBXN8-208ENST00000616306 SMARCA2P51531 1590 aa19.34■□□□□ 0.69
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UBXN8-208ENST00000616306 SLC4A2P04920 1241 aa19.24■□□□□ 0.67
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UBXN8-208ENST00000616306 WIZO95785 1651 aa18.99■□□□□ 0.63
UBXN8-208ENST00000616306 ERCC6Q03468 1493 aa18.97■□□□□ 0.63
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UBXN8-208ENST00000616306 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.93■□□□□ 0.62
UBXN8-208ENST00000616306 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
UBXN8-208ENST00000616306 CUX2O14529 1486 aa18.88■□□□□ 0.61
UBXN8-208ENST00000616306 CAPN15O75808 1086 aa18.84■□□□□ 0.61
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UBXN8-208ENST00000616306 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.81■□□□□ 0.6
UBXN8-208ENST00000616306 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.81■□□□□ 0.6
UBXN8-208ENST00000616306 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
UBXN8-208ENST00000616306 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
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UBXN8-208ENST00000616306 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.79■□□□□ 0.6
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UBXN8-208ENST00000616306 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.75■□□□□ 0.59
UBXN8-208ENST00000616306 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
UBXN8-208ENST00000616306 APLP2Q06481 763 aa18.73■□□□□ 0.59
UBXN8-208ENST00000616306 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
UBXN8-208ENST00000616306 CFTRP13569 1480 aa18.65■□□□□ 0.58
UBXN8-208ENST00000616306 ZBTB22O15209 634 aa18.65■□□□□ 0.58
UBXN8-208ENST00000616306 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
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UBXN8-208ENST00000616306 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.58■□□□□ 0.56
UBXN8-208ENST00000616306 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.56■□□□□ 0.56
UBXN8-208ENST00000616306 WDR62O43379 1518 aa18.55■□□□□ 0.56
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
UBXN8-208ENST00000616306 PRDM2Q13029 1718 aa18.54■□□□□ 0.56
UBXN8-208ENST00000616306 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.53■□□□□ 0.56
UBXN8-208ENST00000616306 DSG3P32926 999 aa18.52■□□□□ 0.56
UBXN8-208ENST00000616306 ABCB7O75027 752 aa18.45■□□□□ 0.54
UBXN8-208ENST00000616306 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
UBXN8-208ENST00000616306 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.31■□□□□ 0.52
UBXN8-208ENST00000616306 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
UBXN8-208ENST00000616306 ABCC8Q09428 1581 aa18.29■□□□□ 0.52
UBXN8-208ENST00000616306 TOPBP1Q92547 1522 aa18.26■□□□□ 0.51
UBXN8-208ENST00000616306 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.23■□□□□ 0.51
UBXN8-208ENST00000616306 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
UBXN8-208ENST00000616306 IFT140Q96RY7 1462 aa18.2■□□□□ 0.5
UBXN8-208ENST00000616306 POLA2Q14181 598 aa18.18■□□□□ 0.5
UBXN8-208ENST00000616306 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.16■□□□□ 0.5
UBXN8-208ENST00000616306 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.13■□□□□ 0.49
UBXN8-208ENST00000616306 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
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