RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594319.1

ANKDD1B-203, Transcript of ankyrin repeat and death domain containing 1B, humanhuman

TSL 5

Gene ANKDD1B, Length 791 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKDD1B-203ENST00000594319 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
ANKDD1B-203ENST00000594319 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.81■■■■□ 3.32
ANKDD1B-203ENST00000594319 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
ANKDD1B-203ENST00000594319 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
ANKDD1B-203ENST00000594319 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.44■■■□□ 2.3
ANKDD1B-203ENST00000594319 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.15■■■□□ 2.26
ANKDD1B-203ENST00000594319 FOXD1Q16676 465 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKDD1B-203ENST00000594319 ADRA2BP18089 450 aa27.79■■■□□ 2.04
ANKDD1B-203ENST00000594319 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.77■■■□□ 2.04
ANKDD1B-203ENST00000594319 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
ANKDD1B-203ENST00000594319 MSH5O43196 834 aa26.6■■□□□ 1.85
ANKDD1B-203ENST00000594319 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.03■■□□□ 1.76
ANKDD1B-203ENST00000594319 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.68■■□□□ 1.7
ANKDD1B-203ENST00000594319 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
ANKDD1B-203ENST00000594319 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ANKDD1B-203ENST00000594319 KCNA4P22459 653 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKDD1B-203ENST00000594319 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
ANKDD1B-203ENST00000594319 ABCC9O60706 1549 aa25.04■■□□□ 1.6
ANKDD1B-203ENST00000594319 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.95■■□□□ 1.58
ANKDD1B-203ENST00000594319 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.8■■□□□ 1.56
ANKDD1B-203ENST00000594319 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
ANKDD1B-203ENST00000594319 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
ANKDD1B-203ENST00000594319 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ANKDD1B-203ENST00000594319 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.41■■□□□ 1.5
ANKDD1B-203ENST00000594319 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.39■■□□□ 1.49
ANKDD1B-203ENST00000594319 NACADO15069 1562 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKDD1B-203ENST00000594319 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKDD1B-203ENST00000594319 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
ANKDD1B-203ENST00000594319 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.29■■□□□ 1.48
ANKDD1B-203ENST00000594319 POTEDQ86YR6 584 aa24.1■■□□□ 1.45
ANKDD1B-203ENST00000594319 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
ANKDD1B-203ENST00000594319 DCAF8L1A6NGE4 600 aa23.88■■□□□ 1.41
ANKDD1B-203ENST00000594319 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.8■■□□□ 1.4
ANKDD1B-203ENST00000594319 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.8■■□□□ 1.4
ANKDD1B-203ENST00000594319 SCRIBQ14160 1630 aa23.73■■□□□ 1.39
ANKDD1B-203ENST00000594319 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKDD1B-203ENST00000594319 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
ANKDD1B-203ENST00000594319 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKDD1B-203ENST00000594319 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKDD1B-203ENST00000594319 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
ANKDD1B-203ENST00000594319 SLC4A2P04920 1241 aa23.22■■□□□ 1.31
ANKDD1B-203ENST00000594319 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKDD1B-203ENST00000594319 ZBTB22O15209 634 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKDD1B-203ENST00000594319 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.03■■□□□ 1.28
ANKDD1B-203ENST00000594319 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ANKDD1B-203ENST00000594319 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKDD1B-203ENST00000594319 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
ANKDD1B-203ENST00000594319 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
ANKDD1B-203ENST00000594319 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ANKDD1B-203ENST00000594319 SMARCA4P51532 1647 aa22.77■■□□□ 1.24
ANKDD1B-203ENST00000594319 RNF39Q9H2S5 420 aa22.76■■□□□ 1.23
ANKDD1B-203ENST00000594319 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKDD1B-203ENST00000594319 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.68■■□□□ 1.22
ANKDD1B-203ENST00000594319 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
ANKDD1B-203ENST00000594319 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ANKDD1B-203ENST00000594319 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKDD1B-203ENST00000594319 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1B-203ENST00000594319 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKDD1B-203ENST00000594319 SMARCA2P51531 1590 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKDD1B-203ENST00000594319 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ANKDD1B-203ENST00000594319 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ANKDD1B-203ENST00000594319 NCAPD3P42695 1498 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKDD1B-203ENST00000594319 WIZO95785 1651 aa22.46■■□□□ 1.19
ANKDD1B-203ENST00000594319 HMGXB3Q12766 1538 aa22.42■■□□□ 1.18
ANKDD1B-203ENST00000594319 APLP2Q06481 763 aa22.39■■□□□ 1.17
ANKDD1B-203ENST00000594319 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ANKDD1B-203ENST00000594319 ATXN8OSP0DMR3 200 aa22.3■■□□□ 1.16
ANKDD1B-203ENST00000594319 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ANKDD1B-203ENST00000594319 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ANKDD1B-203ENST00000594319 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ANKDD1B-203ENST00000594319 CAPN15O75808 1086 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKDD1B-203ENST00000594319 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ANKDD1B-203ENST00000594319 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ANKDD1B-203ENST00000594319 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKDD1B-203ENST00000594319 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ANKDD1B-203ENST00000594319 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.96■■□□□ 1.11
ANKDD1B-203ENST00000594319 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKDD1B-203ENST00000594319 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKDD1B-203ENST00000594319 NESP48681 1621 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKDD1B-203ENST00000594319 CFTRP13569 1480 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKDD1B-203ENST00000594319 ABCB7O75027 752 aa21.73■■□□□ 1.07
ANKDD1B-203ENST00000594319 POLA2Q14181 598 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKDD1B-203ENST00000594319 PRDM2Q13029 1718 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKDD1B-203ENST00000594319 DSG3P32926 999 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKDD1B-203ENST00000594319 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.63■■□□□ 1.05
ANKDD1B-203ENST00000594319 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKDD1B-203ENST00000594319 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKDD1B-203ENST00000594319 ERCC6Q03468 1493 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKDD1B-203ENST00000594319 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKDD1B-203ENST00000594319 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ANKDD1B-203ENST00000594319 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.4■■□□□ 1.02
ANKDD1B-203ENST00000594319 WDR62O43379 1518 aa21.36■■□□□ 1.01
ANKDD1B-203ENST00000594319 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
ANKDD1B-203ENST00000594319 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
ANKDD1B-203ENST00000594319 FBLN2P98095 1184 aa21.31■■□□□ 1
ANKDD1B-203ENST00000594319 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.29■■□□□ 1
ANKDD1B-203ENST00000594319 ABCC8Q09428 1581 aa21.28■■□□□ 1
ANKDD1B-203ENST00000594319 TOPBP1Q92547 1522 aa21.28■■□□□ 1
ANKDD1B-203ENST00000594319 CUX1P39880 1505 aa21.26■□□□□ 0.99
ANKDD1B-203ENST00000594319 CUX2O14529 1486 aa21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms