RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRB-211ENST00000552253 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.81□□□□□ -1
PTPRB-211ENST00000552253 CUX2O14529 1486 aa8.81□□□□□ -1
PTPRB-211ENST00000552253 MIER1Q8N108 512 aa8.8□□□□□ -1
PTPRB-211ENST00000552253 CLSPNQ9HAW4 1339 aa8.8□□□□□ -1
PTPRB-211ENST00000552253 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRB-211ENST00000552253 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.79□□□□□ -1
PTPRB-211ENST00000552253 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRB-211ENST00000552253 MAP3K1Q13233 1512 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-211ENST00000552253 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRB-211ENST00000552253 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.75□□□□□ -1.01
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