RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551634.5

NPAS3-211, Transcript of neuronal PAS domain protein 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene NPAS3, Length 2,718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3-211ENST00000551634 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.26■■■■■ 5.32
NPAS3-211ENST00000551634 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.03■■■■■ 4.16
NPAS3-211ENST00000551634 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41■■■■■ 4.15
NPAS3-211ENST00000551634 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
NPAS3-211ENST00000551634 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
NPAS3-211ENST00000551634 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.77■■■■□ 3.96
NPAS3-211ENST00000551634 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.66■■■■□ 3.94
NPAS3-211ENST00000551634 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.56■■■■□ 3.92
NPAS3-211ENST00000551634 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.5■■■■□ 3.91
NPAS3-211ENST00000551634 HRCP23327 699 aa39.05■■■■□ 3.84
NPAS3-211ENST00000551634 ABCC9O60706 1549 aa38.66■■■■□ 3.78
NPAS3-211ENST00000551634 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.64■■■■□ 3.78
NPAS3-211ENST00000551634 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.33■■■■□ 3.73
NPAS3-211ENST00000551634 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
NPAS3-211ENST00000551634 SCRIBQ14160 1630 aa38.22■■■■□ 3.71
NPAS3-211ENST00000551634 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
NPAS3-211ENST00000551634 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.98■■■■□ 3.67
NPAS3-211ENST00000551634 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
NPAS3-211ENST00000551634 NACADO15069 1562 aa37.8■■■■□ 3.64
NPAS3-211ENST00000551634 TRIM41Q8WV44 630 aa37.79■■■■□ 3.64
NPAS3-211ENST00000551634 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.48■■■■□ 3.59
NPAS3-211ENST00000551634 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
NPAS3-211ENST00000551634 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.44■■■■□ 3.58
NPAS3-211ENST00000551634 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
NPAS3-211ENST00000551634 WIZO95785 1651 aa37.24■■■■□ 3.55
NPAS3-211ENST00000551634 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
NPAS3-211ENST00000551634 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
NPAS3-211ENST00000551634 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.8■■■■□ 3.48
NPAS3-211ENST00000551634 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
NPAS3-211ENST00000551634 SMARCA4P51532 1647 aa36.67■■■■□ 3.46
NPAS3-211ENST00000551634 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
NPAS3-211ENST00000551634 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.56■■■■□ 3.44
NPAS3-211ENST00000551634 SMARCA2P51531 1590 aa36.55■■■■□ 3.44
NPAS3-211ENST00000551634 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.49■■■■□ 3.43
NPAS3-211ENST00000551634 ABCC8Q09428 1581 aa36.47■■■■□ 3.43
NPAS3-211ENST00000551634 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.44■■■■□ 3.42
NPAS3-211ENST00000551634 EEA1Q15075 1411 aa36.37■■■■□ 3.41
NPAS3-211ENST00000551634 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.3■■■■□ 3.4
NPAS3-211ENST00000551634 CEP162Q5TB80 1403 aa36.29■■■■□ 3.4
NPAS3-211ENST00000551634 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.39
NPAS3-211ENST00000551634 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
NPAS3-211ENST00000551634 SOGA1O94964 1423 aa36.22■■■■□ 3.39
NPAS3-211ENST00000551634 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.14■■■■□ 3.38
NPAS3-211ENST00000551634 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.07■■■■□ 3.36
NPAS3-211ENST00000551634 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
NPAS3-211ENST00000551634 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
NPAS3-211ENST00000551634 GOLGA3Q08378 1498 aa36.02■■■■□ 3.36
NPAS3-211ENST00000551634 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.99■■■■□ 3.35
NPAS3-211ENST00000551634 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.98■■■■□ 3.35
NPAS3-211ENST00000551634 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
NPAS3-211ENST00000551634 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.8■■■■□ 3.32
NPAS3-211ENST00000551634 KIF21BO75037 1637 aa35.79■■■■□ 3.32
NPAS3-211ENST00000551634 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
NPAS3-211ENST00000551634 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
NPAS3-211ENST00000551634 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
NPAS3-211ENST00000551634 SYNJ1O43426 1573 aa35.71■■■■□ 3.31
NPAS3-211ENST00000551634 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.63■■■■□ 3.29
NPAS3-211ENST00000551634 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
NPAS3-211ENST00000551634 CLIP1P30622 1438 aa35.56■■■■□ 3.28
NPAS3-211ENST00000551634 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
NPAS3-211ENST00000551634 NEUROD1Q13562 356 aa35.55■■■■□ 3.28
NPAS3-211ENST00000551634 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.5■■■■□ 3.27
NPAS3-211ENST00000551634 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
NPAS3-211ENST00000551634 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.36■■■■□ 3.25
NPAS3-211ENST00000551634 TOP2BQ02880 1626 aa35.35■■■■□ 3.25
NPAS3-211ENST00000551634 APLP2Q06481 763 aa35.28■■■■□ 3.24
NPAS3-211ENST00000551634 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.27■■■■□ 3.24
NPAS3-211ENST00000551634 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.25■■■■□ 3.23
NPAS3-211ENST00000551634 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
NPAS3-211ENST00000551634 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.23■■■■□ 3.23
NPAS3-211ENST00000551634 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.18■■■■□ 3.22
NPAS3-211ENST00000551634 PRXQ9BXM0 1461 aa35.09■■■■□ 3.21
NPAS3-211ENST00000551634 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.01■■■■□ 3.2
NPAS3-211ENST00000551634 HMGXB3Q12766 1538 aa35■■■■□ 3.19
NPAS3-211ENST00000551634 NCAPD3P42695 1498 aa34.95■■■■□ 3.19
NPAS3-211ENST00000551634 ARAP1Q96P48 1450 aa34.94■■■■□ 3.18
NPAS3-211ENST00000551634 MIER1Q8N108 512 aa34.9■■■■□ 3.18
NPAS3-211ENST00000551634 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
NPAS3-211ENST00000551634 CUX1P39880 1505 aa34.85■■■■□ 3.17
NPAS3-211ENST00000551634 KIF27Q86VH2 1401 aa34.84■■■■□ 3.17
NPAS3-211ENST00000551634 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
NPAS3-211ENST00000551634 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.15
NPAS3-211ENST00000551634 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
NPAS3-211ENST00000551634 CFTRP13569 1480 aa34.74■■■■□ 3.15
NPAS3-211ENST00000551634 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
NPAS3-211ENST00000551634 CUX2O14529 1486 aa34.66■■■■□ 3.14
NPAS3-211ENST00000551634 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.59■■■■□ 3.13
NPAS3-211ENST00000551634 PRDM2Q13029 1718 aa34.55■■■■□ 3.12
NPAS3-211ENST00000551634 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.53■■■■□ 3.12
NPAS3-211ENST00000551634 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.52■■■■□ 3.12
NPAS3-211ENST00000551634 MAP3K1Q13233 1512 aa34.46■■■■□ 3.11
NPAS3-211ENST00000551634 IGF1RP08069 1367 aa34.39■■■■□ 3.1
NPAS3-211ENST00000551634 MYT1Q01538 1121 aa34.34■■■■□ 3.09
NPAS3-211ENST00000551634 TIAM1Q13009 1591 aa34.32■■■■□ 3.09
NPAS3-211ENST00000551634 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.25■■■■□ 3.07
NPAS3-211ENST00000551634 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.24■■■■□ 3.07
NPAS3-211ENST00000551634 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.21■■■■□ 3.07
NPAS3-211ENST00000551634 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.18■■■■□ 3.06
NPAS3-211ENST00000551634 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.18■■■■□ 3.06
NPAS3-211ENST00000551634 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.16■■■■□ 3.06
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