RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502049.2

LRP4-AS1-201, LRP4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LRP4-AS1, Length 1,504 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4-AS1-201ENST00000502049 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.24■□□□□ 0.99
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
LRP4-AS1-201ENST00000502049 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
LRP4-AS1-201ENST00000502049 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.43■□□□□ 0.54
LRP4-AS1-201ENST00000502049 FOXD1Q16676 465 aa17.39■□□□□ 0.37
LRP4-AS1-201ENST00000502049 PLPPR3Q6T4P5 718 aa17.18■□□□□ 0.34
LRP4-AS1-201ENST00000502049 ADRA2BP18089 450 aa16.46■□□□□ 0.23
LRP4-AS1-201ENST00000502049 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.45■□□□□ 0.22
LRP4-AS1-201ENST00000502049 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
LRP4-AS1-201ENST00000502049 MSH5O43196 834 aa16.28■□□□□ 0.2
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.05■□□□□ 0.16
LRP4-AS1-201ENST00000502049 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
LRP4-AS1-201ENST00000502049 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.34■□□□□ 0.05
LRP4-AS1-201ENST00000502049 ABCC9O60706 1549 aa15.25■□□□□ 0.03
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
LRP4-AS1-201ENST00000502049 POTEDQ86YR6 584 aa15.22■□□□□ 0.03
LRP4-AS1-201ENST00000502049 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.2■□□□□ 0.02
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.1■□□□□ 0.01
LRP4-AS1-201ENST00000502049 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.06■□□□□ 0
LRP4-AS1-201ENST00000502049 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.01□□□□□ -0.01
LRP4-AS1-201ENST00000502049 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
LRP4-AS1-201ENST00000502049 NACADO15069 1562 aa14.96□□□□□ -0.01
LRP4-AS1-201ENST00000502049 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.94□□□□□ -0.02
LRP4-AS1-201ENST00000502049 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.86□□□□□ -0.03
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SCRIBQ14160 1630 aa14.81□□□□□ -0.04
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.74□□□□□ -0.05
LRP4-AS1-201ENST00000502049 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LRP4-AS1-201ENST00000502049 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.55□□□□□ -0.08
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LRP4-AS1-201ENST00000502049 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
LRP4-AS1-201ENST00000502049 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LRP4-AS1-201ENST00000502049 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.42□□□□□ -0.1
LRP4-AS1-201ENST00000502049 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.4□□□□□ -0.1
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.35□□□□□ -0.11
LRP4-AS1-201ENST00000502049 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
LRP4-AS1-201ENST00000502049 KCNA4P22459 653 aa14.32□□□□□ -0.12
LRP4-AS1-201ENST00000502049 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.31□□□□□ -0.12
LRP4-AS1-201ENST00000502049 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
LRP4-AS1-201ENST00000502049 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.25□□□□□ -0.13
LRP4-AS1-201ENST00000502049 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SMARCA4P51532 1647 aa14.17□□□□□ -0.14
LRP4-AS1-201ENST00000502049 WIZO95785 1651 aa14.14□□□□□ -0.15
LRP4-AS1-201ENST00000502049 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.05□□□□□ -0.16
LRP4-AS1-201ENST00000502049 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
LRP4-AS1-201ENST00000502049 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
LRP4-AS1-201ENST00000502049 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.96□□□□□ -0.17
LRP4-AS1-201ENST00000502049 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.95□□□□□ -0.18
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SMARCA2P51531 1590 aa13.93□□□□□ -0.18
LRP4-AS1-201ENST00000502049 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
LRP4-AS1-201ENST00000502049 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.86□□□□□ -0.19
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.85□□□□□ -0.19
LRP4-AS1-201ENST00000502049 RNF39Q9H2S5 420 aa13.85□□□□□ -0.19
LRP4-AS1-201ENST00000502049 NCAPD3P42695 1498 aa13.82□□□□□ -0.2
LRP4-AS1-201ENST00000502049 HMGXB3Q12766 1538 aa13.78□□□□□ -0.2
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.78□□□□□ -0.2
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
LRP4-AS1-201ENST00000502049 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
LRP4-AS1-201ENST00000502049 TRIM41Q8WV44 630 aa13.65□□□□□ -0.22
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SLC4A2P04920 1241 aa13.58□□□□□ -0.24
LRP4-AS1-201ENST00000502049 ABCC8Q09428 1581 aa13.56□□□□□ -0.24
LRP4-AS1-201ENST00000502049 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CFTRP13569 1480 aa13.51□□□□□ -0.25
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.48□□□□□ -0.25
LRP4-AS1-201ENST00000502049 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
LRP4-AS1-201ENST00000502049 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
LRP4-AS1-201ENST00000502049 PRDM2Q13029 1718 aa13.42□□□□□ -0.26
LRP4-AS1-201ENST00000502049 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
LRP4-AS1-201ENST00000502049 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SYNJ1O43426 1573 aa13.41□□□□□ -0.26
LRP4-AS1-201ENST00000502049 APLP2Q06481 763 aa13.4□□□□□ -0.26
LRP4-AS1-201ENST00000502049 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.39□□□□□ -0.27
LRP4-AS1-201ENST00000502049 NESP48681 1621 aa13.38□□□□□ -0.27
LRP4-AS1-201ENST00000502049 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.35□□□□□ -0.27
LRP4-AS1-201ENST00000502049 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.35□□□□□ -0.27
LRP4-AS1-201ENST00000502049 TOP2BQ02880 1626 aa13.34□□□□□ -0.27
LRP4-AS1-201ENST00000502049 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
LRP4-AS1-201ENST00000502049 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.33□□□□□ -0.27
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
LRP4-AS1-201ENST00000502049 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.32□□□□□ -0.28
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CUX1P39880 1505 aa13.32□□□□□ -0.28
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SOGA1O94964 1423 aa13.32□□□□□ -0.28
LRP4-AS1-201ENST00000502049 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.28□□□□□ -0.28
LRP4-AS1-201ENST00000502049 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.27□□□□□ -0.29
LRP4-AS1-201ENST00000502049 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.27□□□□□ -0.29
LRP4-AS1-201ENST00000502049 EEA1Q15075 1411 aa13.26□□□□□ -0.29
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CAPN15O75808 1086 aa13.25□□□□□ -0.29
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.24□□□□□ -0.29
LRP4-AS1-201ENST00000502049 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.23□□□□□ -0.29
LRP4-AS1-201ENST00000502049 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
LRP4-AS1-201ENST00000502049 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.21□□□□□ -0.3
LRP4-AS1-201ENST00000502049 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.2□□□□□ -0.3
LRP4-AS1-201ENST00000502049 TOPBP1Q92547 1522 aa13.19□□□□□ -0.3
LRP4-AS1-201ENST00000502049 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.18□□□□□ -0.3
LRP4-AS1-201ENST00000502049 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
LRP4-AS1-201ENST00000502049 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
LRP4-AS1-201ENST00000502049 KIF27Q86VH2 1401 aa13.14□□□□□ -0.31
LRP4-AS1-201ENST00000502049 ZBTB22O15209 634 aa13.13□□□□□ -0.31
LRP4-AS1-201ENST00000502049 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms