RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501224.3

EXTL3-AS1-201, EXTL3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene EXTL3-AS1, Length 3,691 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.21■■□□□ 1.31
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.13■□□□□ 0.81
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.05■□□□□ 0.8
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.68■□□□□ 0.74
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 HRCP23327 699 aa19.42■□□□□ 0.7
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.39■□□□□ 0.69
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.36■□□□□ 0.69
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.15■□□□□ 0.66
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.92■□□□□ 0.62
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.81■□□□□ 0.6
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 ABCC9O60706 1549 aa18.74■□□□□ 0.59
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.45■□□□□ 0.54
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 SCRIBQ14160 1630 aa18.29■□□□□ 0.52
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 NACADO15069 1562 aa18.29■□□□□ 0.52
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.2■□□□□ 0.5
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.16■□□□□ 0.5
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 NEUROD1Q13562 356 aa18.09■□□□□ 0.49
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.98■□□□□ 0.47
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa17.98■□□□□ 0.47
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 WIZO95785 1651 aa17.96■□□□□ 0.47
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.93■□□□□ 0.46
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 TRIM41Q8WV44 630 aa17.82■□□□□ 0.44
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 SMARCA4P51532 1647 aa17.77■□□□□ 0.44
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.72■□□□□ 0.43
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.72■□□□□ 0.43
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 SMARCA2P51531 1590 aa17.67■□□□□ 0.42
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.45■□□□□ 0.38
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 MYT1Q01538 1121 aa17.38■□□□□ 0.37
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 MIER1Q8N108 512 aa17.37■□□□□ 0.37
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 ABCC8Q09428 1581 aa17.36■□□□□ 0.37
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.28■□□□□ 0.36
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 SYNJ1O43426 1573 aa17.21■□□□□ 0.35
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 KIF21BO75037 1637 aa17.19■□□□□ 0.34
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.18■□□□□ 0.34
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 PRDM2Q13029 1718 aa17.14■□□□□ 0.33
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.1■□□□□ 0.33
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.09■□□□□ 0.33
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 EEA1Q15075 1411 aa17.08■□□□□ 0.33
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 SOGA1O94964 1423 aa17.07■□□□□ 0.32
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 TOP2BQ02880 1626 aa17.07■□□□□ 0.32
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 HMGXB3Q12766 1538 aa17.03■□□□□ 0.32
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.01■□□□□ 0.31
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 BCANQ96GW7 911 aa17■□□□□ 0.31
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CEP162Q5TB80 1403 aa16.96■□□□□ 0.31
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 BCL11AQ9H165 835 aa16.94■□□□□ 0.3
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.93■□□□□ 0.3
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 KCNH8Q96L42 1107 aa16.9■□□□□ 0.3
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.89■□□□□ 0.29
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 GOLGA3Q08378 1498 aa16.89■□□□□ 0.29
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.85■□□□□ 0.29
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.84■□□□□ 0.29
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 NCAPD3P42695 1498 aa16.84■□□□□ 0.29
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.81■□□□□ 0.28
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CUX1P39880 1505 aa16.78■□□□□ 0.28
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 PRXQ9BXM0 1461 aa16.77■□□□□ 0.28
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.75■□□□□ 0.27
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 ITGAEP38570 1179 aa16.72■□□□□ 0.27
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.72■□□□□ 0.27
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CFTRP13569 1480 aa16.7■□□□□ 0.26
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 ARAP1Q96P48 1450 aa16.67■□□□□ 0.26
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 FKBP8Q14318 412 aa16.66■□□□□ 0.26
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.65■□□□□ 0.26
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CLIP1P30622 1438 aa16.64■□□□□ 0.25
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 WDR97A6NE52 1622 aa16.6■□□□□ 0.25
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CUX2O14529 1486 aa16.58■□□□□ 0.24
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 APLP2Q06481 763 aa16.57■□□□□ 0.24
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 TRIM52Q96A61 297 aa16.55■□□□□ 0.24
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.51■□□□□ 0.23
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
EXTL3-AS1-201ENST00000501224 MAP3K1Q13233 1512 aa16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms